動物線粒體(tǐ)提取試劑盒(細胞樣品)
(Animal Cell Mitochondria Isolation
Kit)
産品貨号
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名稱
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規格
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RTD8115
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動物細胞線粒體(tǐ)提取試劑盒(細胞樣品)
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50次
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● 産品簡介
動物細胞線粒體(tǐ)提取試劑盒(Animal
Cell Mitochondria Isolation Kit)可(kě)以快(kuài)速便捷分(fēn)離(lí)培養細胞的線粒體(tǐ)。試劑盒的緩沖系統不含任何表面活性劑和螯合劑EDTA,分(fēn)離(lí)獲得(de)的線粒體(tǐ)純度較高,并且絕大(dà)部分(fēn)分(fēn)離(lí)獲得(de)的線粒體(tǐ)都(dōu)含有完整的内膜和外膜,可(kě)以用于線粒體(tǐ)的生(shēng)理(lǐ)功能等方面的研究。另外,優化的裂解配方配套離(lí)心柱法有效裂解細胞,省去(qù)了經典方法使用玻璃勻漿器的繁瑣操作(zuò),更加省時省力。同時,本試劑盒在分(fēn)離(lí)線粒體(tǐ)的同時可(kě)以獲得(de)去(qù)除線粒體(tǐ)的細胞胞漿蛋白(bái),可(kě)以研究線粒體(tǐ)蛋白(bái)向胞漿内的運輸機(jī)制。
該産品約30分(fēn)鍾即可(kě)完成培養細胞線粒體(tǐ)的提取。線粒體(tǐ)是在溫和、非變性條件(jiàn)下提取的,結合不同的溶解液,溶解後的線粒體(tǐ)可(kě)以用于SDS-PAGE變性電泳檢測、Blue
Native非變性電泳檢測以及等電聚焦電泳等。另外,提取的線粒體(tǐ)具有生(shēng)理(lǐ)功能,可(kě)以用于線粒體(tǐ)的生(shēng)理(lǐ)功能等方面的研究。
按照(zhào)每次提取2×107細胞計(jì)算,試劑盒可(kě)以使用大(dà)約50次。
● 産品組成
産品編号
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名稱
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規格
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貯存
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RTD8115-01
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分(fēn)離(lí)緩沖液A
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15 ml
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-20℃
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RTD8115-02
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分(fēn)離(lí)緩沖液B
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15 ml
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-20℃
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RTD8115-03
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漂洗緩沖液
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30 ml
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-20℃
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RTD8115-04
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貯存緩沖液
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3 ml
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-20℃
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PS1020
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變性蛋白(bái)溶解液
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5 ml
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RT
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CD-50
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離(lí)心柱套裝
(包含離(lí)心柱和2ml連蓋收集管)
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50個
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RT
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說(shuō)明書(shū)
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● 貯存條件(jiàn)和運輸:
按照(zhào)标簽溫度貯存;有效期一年(nián);濕冰運輸。
● 用前必讀(dú):
1. 離(lí)心機(jī)請(qǐng)調整成RCF/g模式,按照(zhào)離(lí)心力設置離(lí)心機(jī)(不要根據轉速rpm模式設置),所有離(lí)心步驟都(dōu)需要在4℃低溫離(lí)心機(jī)中進行。
2. 将分(fēn)離(lí)緩沖液A,分(fēn)離(lí)緩沖液B,漂洗緩沖液和貯存緩沖液混勻後放(fàng)置于冰上。将離(lí)心柱套入2 ml連蓋收集管中,蓋好管蓋,放(fàng)置于冰上預冷(lěng)。
3. 蛋白(bái)提取推薦添加蛋白(bái)酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供),根據蛋白(bái)酶抑制劑母液濃度提前添加在膜蛋白(bái)提取溶液中(如(rú)抑制劑母液是 100×,添加時按照(zhào)1:100添加,即1ml膜蛋白(bái)提取溶液添加10μl抑制劑)。研究蛋白(bái)磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)。
4.
蛋白(bái)定量推薦使用BCA方法,可(kě)以選擇BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)。
● 使用方法:
一. 準備溶液:
常溫溶解試劑盒中的各種溶液,溶解後立即置于冰上并混勻。如(rú)果最終實驗目的是制備線粒體(tǐ)蛋白(bái)樣品,根據樣品數量,取适量體(tǐ)積分(fēn)離(lí)緩沖液A加入蛋白(bái)酶抑制劑。按照(zhào)下表大(dà)體(tǐ)估算分(fēn)離(lí)緩沖液A的使用體(tǐ)積:
細胞類型
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培養器皿
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細胞數量
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細胞沉澱體(tǐ)積(PCV)(μl)
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分(fēn)離(lí)緩沖液A(μl)
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懸浮細胞
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~2×107
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~200
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250
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貼壁細胞
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96孔闆
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~1×105
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調整細胞數目到2×107
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250
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24孔闆
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~5×105
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6孔闆
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~2.5×106
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25cm2培養瓶
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~2×106
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75cm2培養瓶
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~8×106
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35
mm培養皿
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~2×106
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60
mm培養皿
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~5×106
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100
mm培養皿
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~1.5×107
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注:(二百萬,2×106)HeLa細胞,其細胞沉澱體(tǐ)積(PCV,Packed Cell Volume)大(dà)約爲20 μl。
二. 收集細胞:
2.1
對于貼壁細胞:細胞用PBS漂洗一遍,棄PBS;再加入适量PBS,用細胞刮刀刮下細胞,或用0.02%
EDTA(0.5
mM)溶液處理(lǐ)細胞使細胞不再貼壁很緊,并用移液器吹打下細胞。400
g(~2000
rpm)
4℃離(lí)心5
min收集細胞,盡最大(dà)努力吸盡上清,留下細胞沉澱備用。盡量避免用胰酶消化細胞,以免胰酶降解需提取的目的蛋白(bái)。
2.2
對于懸浮細胞:400
g(~2000
rpm)4℃離(lí)心5
min收集細胞,用PBS洗一遍,離(lí)心收集細胞,盡最大(dà)努力吸盡上清,留下細胞沉澱備用。
三. 裂解細胞膜:
3.1細胞沉澱中加入250
μl準備好的分(fēn)離(lí)緩沖液A(含蛋白(bái)酶抑制劑),用移液器吹打重懸細胞沉澱,渦旋劇(jù)烈震蕩30-60秒,冰浴處理(lǐ)10分(fēn)鍾,間歇2-3混勻。
注:建議(yì)将起始細胞數不要低于2×107,否則将導緻最後線粒體(tǐ)得(de)率過低。
3.2
将細胞懸液轉移到離(lí)心柱中,蓋上管蓋,16,000
g(~13000
rpm) 4℃離(lí)心1分(fēn)鍾,離(lí)心後收集管底部會有沉澱形成。
注:離(lí)心柱最大(dà)體(tǐ)積爲600 μl;确保離(lí)心機(jī)可(kě)以在10秒内達到16000 g。
3.3 棄去(qù)離(lí)心柱,蓋好2
ml收集管管蓋,用1ml移液器輕柔吹打重懸收集管中的沉澱。
四. 去(qù)除細胞核和未破碎的細胞:
溶液700 g(~2700 rpm)
4℃離(lí)心1分(fēn)鍾,用200
μl吸頭小心将上清(上清稍有渾濁)轉移到新的1.5
ml離(lí)心管中。注意:轉速不要超過700g,否則會降低線粒體(tǐ)的得(de)率。
關鍵步驟:吸取上清時不要觸及沉澱,甚至可(kě)以丢棄部分(fēn)上清不吸取,以免上清(含線粒體(tǐ))中污染核蛋白(bái)。如(rú)果使用250 μl分(fēn)離(lí)緩沖液A,建議(yì)吸取200 μl上清。此步驟得(de)到的細胞核純度不高,混雜有沒有完全破碎的完整細胞,不建議(yì)用于相(xiàng)關實驗。
五. 收集線粒體(tǐ):
5.1
上清中加入等體(tǐ)積的分(fēn)離(lí)緩沖液B(如(rú)步驟4吸取200
μl上清,則加入200
μl分(fēn)離(lí)緩沖液B),混勻;
5.2
16000 g(~13000
rpm)
4℃離(lí)心10分(fēn)鍾,用200
μl吸頭吸去(qù)上清,沉澱即爲提取的線粒體(tǐ)。上清是胞漿蛋白(bái),如(rú)需要可(kě)保存備用。
關鍵步驟:此步驟必須完全将上清吸取幹淨,可(kě)以用200μl吸頭分(fēn)次吸取上清,最後用10 μl吸頭将殘餘上清徹底吸淨,以免線粒體(tǐ)中污染胞漿蛋白(bái)。
六. 線粒體(tǐ)漂洗:
線粒體(tǐ)沉澱中加入0.5 ml 漂洗緩沖液,輕柔重懸沉澱,16,000 g,4℃離(lí)心5分(fēn)鍾,棄上清,沉澱即爲漂洗後的線粒體(tǐ)。
七. 線粒體(tǐ)的使用:
7.1 線粒體(tǐ)功能研究:
如(rú)果用于完整線粒體(tǐ)的功能或酶活性研究,初始2×107細胞分(fēn)離(lí)得(de)到的線粒體(tǐ)樣品中加入100-150
μl線粒體(tǐ)貯存緩沖液,重懸線粒體(tǐ)後-80℃備用。不建議(yì)長期貯存,盡快(kuài)使用。
7.2 線粒體(tǐ)蛋白(bái)電泳:
7.2.1線粒體(tǐ)蛋白(bái)變性樣品處理(lǐ):
7.2.1.1 初始2×107細胞分(fēn)離(lí)得(de)到的線粒體(tǐ)沉澱中建議(yì)使用50
μl變性蛋白(bái)溶解液(貨号:PS1020)溶解線粒體(tǐ)沉澱;
7.2.1.2
BCA方法測定蛋白(bái)濃度(貨号:RTP7102);
7.2.1.3用變性蛋白(bái)溶解液調整蛋白(bái)濃度爲1
μg/μl,按需分(fēn)裝,每管50
μl,-80℃保存待用;
7.2.1.4取一管50
μl樣品加入SDS-PAGE上樣緩沖液(貨号:PL080,PL113,PL121)處理(lǐ),建議(yì)調整上樣液濃度爲0.5
μg/μl;對于多次跨膜蛋白(bái)(Multi-pass
membrane protein)的變性電泳檢測,樣品建議(yì)使用37℃處理(lǐ)30分(fēn)鍾,不要95℃加熱(rè)5分(fēn)鍾,因爲在95℃高溫情況下,多次跨膜蛋白(bái)極易聚集形成多聚體(tǐ),樣品會聚集,WB檢測會表現爲比實際蛋白(bái)大(dà)小更大(dà)的分(fēn)子量;
7.2.1.5
使用SDS-PAGE凝膠(貨号:RTD6132,RTD6116)電泳,每個泳道上樣10-40
μl(5-20
μg)。
7.2.2 線粒體(tǐ)蛋白(bái)BN非變性樣品處理(lǐ):
7.2.2.1 初始2×107細胞分(fēn)離(lí)得(de)到的線粒體(tǐ)沉澱中建議(yì)使用50
μl膜蛋白(bái)重懸液(BN電泳用)(貨号:PN1020)重懸線粒體(tǐ)沉澱;
7.2.2.2
BCA方法測定蛋白(bái)濃度(貨号:RTP7102);
7.2.2.3 用膜蛋白(bái)重懸液(BN電泳用)(貨号:PN1020)調整蛋白(bái)濃度爲1
μg/μl,按需分(fēn)裝,每管50
μl,-80℃保存待用;
7.2.2.4
取一管50
μl樣品,溶化混勻後4℃
16000 g 5分(fēn)鍾,去(qù)除上清,保留沉澱;
7.2.2.5 沉澱中加入50
μl膜蛋白(bái)增溶液A(貨号:DM1080),輕柔重懸沉澱,盡量不産生(shēng)氣泡,冰浴10分(fēn)鍾;
7.2.2.6 4℃
16000 g 15分(fēn)鍾,取上清至一幹淨1.5 ml離(lí)心管中即爲增溶後線粒體(tǐ)蛋白(bái)溶液(小心不要吸取沉澱),此時得(de)到的線粒體(tǐ)蛋白(bái)濃度爲1
μg/μl,其中去(qù)垢劑DDM(n-Dodecyl
β-D-maltoside,β-DM, n-十二烷基-β-D-麥芽糖苷)終濃度爲1%;
7.2.2.7 線粒體(tǐ)蛋白(bái)溶液中加入1/10體(tǐ)積10×膜蛋白(bái)A型上樣緩沖液(配套膜蛋白(bái)增溶液A使用)(貨号:PL130),使用BN凝膠電泳(貨号:RTD6139,RTD6140),每個泳道上樣5-20
μg。
7.2.3 線粒體(tǐ)蛋白(bái)等電聚焦樣品處理(lǐ)(2D凝膠第一維電泳):
建議(yì)線粒體(tǐ)沉澱中使用溶解液:7
M尿素,2
M硫脲,
2%CHAPS,20 mM DTT(自(zì)備,試劑盒不提供)。
八 線粒體(tǐ)産量和質量的評價:
8.1 線粒體(tǐ)産量:
細胞系
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細胞數量
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線粒體(tǐ)蛋白(bái)
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K562
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2×107
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100-150 μg
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Jurkat
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2×107
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80-100 μg
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Hela
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2×107
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100-150 μg
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NIH-3T3
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2×107
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80-120 μg
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8.2 線粒體(tǐ)質量評價:
線粒體(tǐ)質量評價首先看(kàn)提取的線粒體(tǐ)是否具有完整的内外膜結構(進行線粒體(tǐ)功能活性研究),其次要看(kàn)裂解後的線粒體(tǐ)蛋白(bái)是否有明顯的富集,其三要看(kàn)裂解後的線粒體(tǐ)蛋白(bái)是否有其他(tā)組分(fēn)交叉污染,最後看(kàn)提取的線粒體(tǐ)中是否可(kě)以檢測出目的蛋白(bái)。使用專門(mén)的線粒體(tǐ)内參檢測(下表),可(kě)以初步确認提出的是線粒體(tǐ)蛋白(bái)。線粒體(tǐ)蛋白(bái)是否有效富集需要用總蛋白(bái)作(zuò)爲對照(zhào),與總蛋白(bái)相(xiàng)比,線粒體(tǐ)内參蛋白(bái)是否有明顯富集。線粒體(tǐ)蛋白(bái)中的交叉污染可(kě)以用其他(tā)組分(fēn)内參檢測線粒體(tǐ)蛋白(bái)樣品,如(rú)關注線粒體(tǐ)蛋白(bái)中是否有胞漿蛋白(bái)污染,可(kě)以使用胞漿蛋白(bái)内參檢測線粒體(tǐ)蛋白(bái),檢測條帶的強弱即說(shuō)明線粒體(tǐ)蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)交叉污染的程度。用目标蛋白(bái)抗體(tǐ)檢測線粒體(tǐ)蛋白(bái),驗證是否可(kě)以檢測到目的蛋白(bái),蛋白(bái)大(dà)小是否符合預期。
位置
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内參名稱
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大(dà)小 kD
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細胞膜
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Na-K ATPase
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100
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内質網膜
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Calnexin
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~90
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線粒體(tǐ)膜
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COX IV
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17
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許多研究人(rén)員(yuán)利用
WB對分(fēn)離(lí)的線粒體(tǐ)蛋白(bái)進行純度檢測,經常發現一些常用的胞漿内參能在線粒體(tǐ)蛋白(bái)中檢測到,例如(rú)β-actin[1],
GAPDH [2] 和 β-tubulin,這是由于這些胞漿内參不僅存在于胞漿也存在于線粒體(tǐ)中,因此可(kě)以在線粒體(tǐ)蛋白(bái)中檢測到胞漿内參。更多信息,請(qǐng)參閱以下論文:
1
Hatch, Anna L., Pinar S. Gurel, and Henry N. Higgs. Novel roles for actin in
mitochondrial fission. Journal of Cell Science (2014) 127,
1–12
2
Zhang, Jin-Ying, et al. Critical
protein GAPDH and its regulatory mechanisms in cancer cells. Cancer
Biol Med 2015;12:10-22.
九 實驗示例: