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動物核蛋白(bái)與細胞漿蛋白(bái)抽提試劑盒(細胞樣品)

動物核蛋白(bái)與細胞漿蛋白(bái)抽提試劑盒(細胞樣品)

産品編号:RTD8301

産品規格:50次

數量
價格 ¥500


動物核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(細胞樣品)

Animal Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit for Cells

産品貨号

名稱

規格

RTD8301

動物核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(細胞樣品)

50

 

 

 

産品簡介:

在研究細胞時經常要研究細胞的不同組份,而研究得(de)最多的兩個細胞組份就(jiù)是細胞核和細胞漿。分(fēn)離(lí)核蛋白(bái)和胞漿蛋白(bái),不僅可(kě)以用于研究蛋白(bái)在細胞内的定位,而且可(kě)以用于轉錄調控方面的研究,例如(rú)EMSA(也稱gel shift),footprinting等。動物核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(Animal Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit)提供了一種比較簡單方便地從(cóng)培養細胞中抽提細胞核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)的方法。約90分(fēn)鍾就(jiù)可(kě)以完成培養細胞的細胞核蛋白(bái)與細胞漿蛋白(bái)的分(fēn)離(lí)。抽提得(de)到的蛋白(bái)可(kě)以用于Western,EMSA,footprinting,報告基因檢測以及酶活力測定等實驗。

本試劑盒是通過細胞核提取緩沖液在低滲透壓條件(jiàn)下,使細胞充分(fēn)膨脹,破壞細胞膜,釋放(fàng)出細胞漿蛋白(bái),然後通過離(lí)心得(de)到完整的細胞核(細胞核可(kě)以重懸于細胞核貯存緩沖液中 -80℃貯存);細胞核用核蛋白(bái)提取試劑I裂解,配合核酸酶Benzonase消化掉核酸,離(lí)心得(de)到變性核蛋白(bái);或者使用核蛋白(bái)提取試劑II裂解,離(lí)心得(de)到非變性(活性)核蛋白(bái)。一般情況下,胞漿蛋白(bái)與核蛋白(bái)之間的交叉污染低于10%。

對于細胞樣品,如(rú)果每個樣品的數量5×106-1×107,本試劑盒可(kě)以抽提50個樣品。

産品組成:

産品編号

名稱

規格

貯存

RTD8301-01

細胞裂解緩沖液A

45 ml

-20℃

RTD8301-02

細胞裂解緩沖液B

1 ml

4

RTD8301-03

細胞核貯存緩沖液

0.5 ml

-20℃

RTD8301-04

核蛋白(bái)提取試劑I(變性)

5 ml

-20℃

RTD8301-05

核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)

5 ml

-20

RTD8301-06

台盼藍染色液

0.5 ml

4

PM1790S-01

PMSF溶液(100 mM

1 ml

-20℃

RTT2106-01

Benzonase250 U/μl

50 μl

-20℃

DT0140P-01

1 M DTT

1 ml

4℃(配制後-20)

貯存條件(jiàn)和運輸:

根據标簽溫度貯存;有效期一年(nián);試劑盒濕冰運輸。

用前必讀(dú):

1. 離(lí)心機(jī)請(qǐng)調整成RCF/g模式,按照(zhào)離(lí)心力設置離(lí)心機(jī)(不要根據轉速rpm模式設置),所有離(lí)心步驟都(dōu)需要在4℃低溫離(lí)心機(jī)中進行。

2. 蛋白(bái)提取推薦添加蛋白(bái)酶抑制劑,根據蛋白(bái)酶抑制劑母液濃度提前添加在蛋白(bái)提取溶液中(如(rú)抑制劑母液是 100×,添加時按照(zhào)1:100添加)。研究蛋白(bái)磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)。

3. 蛋白(bái)定量推薦使用BCA方法,可(kě)以選擇BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)。

●  使用方法:

胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)的提取:

1. 1準備溶液:常溫溶解試劑盒中的試劑,溶解後立即放(fàng)置在冰上,混勻。取适當量的細胞裂解緩沖液A,在使用前加入PMSF溶液和/或磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)和1/1000體(tǐ)積的1 M DTT,随後立即放(fàng)于冰上待用。

組份

一次提取需要體(tǐ)積

PMSF溶液

1 M DTT

Benzonase

細胞裂解緩沖液A

(步驟1.4.11.5.1

800 μl

8 μl

0.8 μl

-

核蛋白(bái)提取試劑I(變性)

(步驟1.6.1.2

100 μl

1 μl

0.1 μl

1 μl

核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(步驟1.6.2.2

50 μl

0.5 μl

-

-

1.2 準備細胞:

1.2.1 對于貼壁細胞:用PBS漂洗一遍,棄PBS;再加入适量PBS,用細胞刮刀刮下細胞,或用0.02% EDTA(0.5 mM)溶液處理(lǐ)細胞使細胞不再貼壁很緊,并用移液器吹打下細胞。450 g 4℃離(lí)心5 min收集細胞,盡最大(dà)努力吸盡上清,留下細胞沉澱備用。盡量避免用胰酶消化細胞,以免胰酶降解需抽提的目的蛋白(bái)。

1.2.2 對于懸浮細胞:450 g 4℃離(lí)心5 min收集細胞,用PBS洗一遍,離(lí)心收集細胞,盡最大(dà)努力吸盡上清,留下細胞沉澱備用。

1.3 按照(zhào)下表大(dà)體(tǐ)估算提取溶液使用體(tǐ)積:

細胞類型

培養器皿

細胞數量

細胞沉澱體(tǐ)積(PCV)(μl

細胞裂解緩沖液Aμl

懸浮細胞

 

5-10×106

50

400

貼壁細胞

96孔闆

~1×105

調整細胞數目到5-10×106

24孔闆

~5×105

調整細胞數目到5-10×106

6孔闆

~2.5×106

調整細胞數目到5-10×106

25cm2培養瓶

~2×106

調整細胞數目到5-10×106

75cm2培養瓶

~8×106

~80

35 mm培養皿

~2×106

調整細胞數目到5-10×106

60 mm培養皿

~5×106

~50

100 mm培養皿

~1.5×107

調整細胞數目到5-10×106

注:(二百萬,2×106)HeLa細胞,其細胞沉澱體(tǐ)積(PCV,Packed Cell Volume)大(dà)約爲20 μl。

1.4 胞漿蛋白(bái)提取:

1.4.1細胞沉澱中加入準備好的400 μl細胞裂解緩沖液A(含抑制劑和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸細胞沉澱5-10次,把細胞沉澱完全懸浮并分(fēn)散開,冰浴5分(fēn)鍾。

1.4.2 加入20 μl 細胞裂解緩沖液B(按照(zhào)細胞裂解緩沖液A體(tǐ)積的1/20加入),混勻,冰浴5-10分(fēn)鍾。

        注1:此步驟盡量不要漩渦震蕩沉澱,否則得(de)到的細胞漿蛋白(bái)可(kě)能會污染核蛋白(bái)。

注2:裂解緩沖液對不同細胞的裂解能力有不同,敏感細胞裂解5分(fēn)鍾足夠,其他(tā)細胞冰浴時間不要超過10分(fēn)鍾。

1.4.3 4℃ 16000g 離(lí)心5分(fēn)鍾,取80%上清即爲胞漿蛋白(bái),保存備用。

     注:吸取上清時千萬不要觸及沉澱,可(kě)以隻取80%體(tǐ)積上清,以免胞漿蛋白(bái)中污染細胞核。每5-10×106細胞用400 μl細胞裂解緩沖液A裂解後獲得(de)的上清,其細胞漿蛋白(bái)濃度約爲1-2 μg/μl,不同細胞略有不同。

1.5 收集細胞核:

1.5.1 徹底去(qù)除步驟1.4.3離(lí)心管内上清,沉澱中再次加入400 μl細胞裂解緩沖液A(含PMSF和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸沉澱至沉澱完全散開(注:渦旋震蕩不易懸浮沉澱),冰浴5分(fēn)鍾。

      注:此步驟目的是徹底漂洗沉澱中殘餘的未裂解細胞,可(kě)以大(dà)大(dà)提高細胞核的純度

1.5.2 4℃ 16000g 離(lí)心5-10分(fēn)鍾,徹底去(qù)除上清,沉澱即爲完整的細胞核。

注:盡量完全把上清去(qù)除幹淨,否則細胞核中會污染胞漿蛋白(bái)。

1.5.3 細胞核沉澱中加入50 μl細胞核貯存緩沖液,用吸頭完全重懸沉澱,得(de)到細胞核溶液。該溶液可(kě)以-80℃貯存。

1.5.4 可(kě)選步驟:取10 μl細胞核溶液,加入10 μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分(fēn)鍾,顯微鏡下觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核爲均一藍色,沒有粘連(如(rú)圖)。 pt;mso-ansi-language:EN-US; mso-fareast-language:ZH-CN;mso-bidi-language:AR-SA'>可(kě)選步驟:取10 μl細胞核溶液,加入10 μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分(fēn)鍾,顯微鏡下觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核爲均一藍色,沒有粘連(如(rú)圖)。

 1.6 細胞核蛋白(bái)提取:

1.6.1 變性核蛋白(bái)提取:

注:此步驟使用含有SDS的提取試劑B,完全裂解核膜,釋放(fàng)出細胞核内容物,提取的是完全變性的核蛋白(bái),适用于SDS-PAGE電泳Western Blot檢測。

1.6.1.1 取一管50 μl細胞核溶液,4℃ 16000g 離(lí)心2分(fēn)鍾,去(qù)除上清,保留沉澱。

1.6.1.2 沉澱中加入100 μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性)(含PMSF和DTT)和1 μl Benzonase,吸頭重懸沉澱,37℃處理(lǐ)30分(fēn)鍾至幾乎無可(kě)見(jiàn)不溶物。

注:加入核蛋白(bái)提取試劑I(變性)後,細胞核裂解釋放(fàng)出大(dà)量核酸,溶液非常粘稠,核酸酶Benzonase可(kě)以消化掉核酸,降低粘度。

1.6.1.3 4℃16,000g離(lí)心10分(fēn)鍾,立即吸取上清至一預冷(lěng)的離(lí)心管中,即爲抽提得(de)到的變性核蛋白(bái)。可(kě)以立即使用,也可(kě)以-80℃凍存。每5-10×106細胞用100微升提取試劑B裂解後獲得(de)的上清,可(kě)以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其核蛋白(bái)濃度約爲1-3 μg/μl,不同細胞略有不同。

1.6.2 非變性核蛋白(bái)提取:

注:此步驟使用高鹽緩沖液使得(de)細胞核收縮,核酸結合蛋白(bái)(如(rú)轉錄因子)與核酸分(fēn)離(lí),擴散到細胞核外部,離(lí)心後上清中爲非變性(活性)核蛋白(bái),适用EMSA,轉錄因子活性分(fēn)析等實驗。

1.6.2.1 取一管50 μl細胞核溶液,4℃ 16000g 離(lí)心2分(fēn)鍾,去(qù)除上清,保留沉澱。

1.6.2.2 沉澱中加入50 μl核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(含PMSF,不要添加DTT),吸頭重懸沉澱,4℃旋轉混勻30 min,至最後得(de)到的溶液無可(kě)見(jiàn)懸浮物。

       注:如(rú)不能旋轉混勻,可(kě)以冰浴30 min,每隔5分(fēn)鍾混勻一次。

1.6.2.3 4℃16,000g離(lí)心10分(fēn)鍾,立即吸取上清至一預冷(lěng)的離(lí)心管中,即爲抽提得(de)到的活性核蛋白(bái)。可(kě)以立即使用,也可(kě)以-80℃凍存。每5-10×106細胞用50微升核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)裂解後獲得(de)的上清,可(kě)以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其細胞核蛋白(bái)濃度約爲1-3 μg/μl,不同細胞略有不同。

關于胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)産量和質量的評價:

2.1蛋白(bái)産量:

細胞系

細胞數量

胞漿蛋白(bái)

核蛋白(bái)

K562

1×107

~0.8 mg

~0.2 mg

HEK293

4×107

~9.4 mg

~0.55 mg

Jurkat

1.5×107

~2.6 mg

~0.23 mg

Hela

5.4×106

~1.9 mg

~0.34 mg

NIH-3T3

7.9×106

~1.9 mg

~0.28 mg

2.2 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)質量評價:

蛋白(bái)分(fēn)區提取的質量評價首先看(kàn)提取的蛋白(bái)是否是分(fēn)區蛋白(bái),其次要看(kàn)分(fēn)區蛋白(bái)是否有明顯的富集,其三要看(kàn)提出的分(fēn)區蛋白(bái)是否有其他(tā)組分(fēn)交叉污染,最後看(kàn)提取的分(fēn)區蛋白(bái)中是否可(kě)以檢測出目的蛋白(bái)。使用專門(mén)的胞漿内參和細胞核檢測(下表),可(kě)以初步确認提出的是胞漿蛋白(bái)還(hái)是核蛋白(bái)。蛋白(bái)是否有效富集需要用總蛋白(bái)作(zuò)爲對照(zhào),與總蛋白(bái)相(xiàng)比,胞漿蛋白(bái)内參或核内參是否有明顯富集。交叉污染可(kě)以用其他(tā)組分(fēn)内參檢測蛋白(bái)樣品,如(rú)關注胞漿蛋白(bái)中是否有細胞核蛋白(bái)污染,可(kě)以使用核蛋白(bái)内參如(rú)Lamin B1檢測胞漿蛋白(bái),檢測無條帶即說(shuō)明胞漿蛋白(bái)與細胞核組分(fēn)無交叉污染。用目标蛋白(bái)抗體(tǐ)檢測分(fēn)區蛋白(bái),驗證是否可(kě)以檢測到目的蛋白(bái),蛋白(bái)大(dà)小是否符合預期。

位置

内參名稱

大(dà)小 kD

 

胞漿蛋白(bái)内參

GAPDH

37

 

β-Actin

45

 

β-Tubulin

55

推薦

核内參

Histone H3

17

存在于線粒體(tǐ)中,胞漿中可(kě)以檢測到

PCNA

36

 

Lamin B1

68

推薦

實驗示例:

 

  

Jurkat總蛋白(bái),細胞漿蛋白(bái),細胞核蛋白(bái)GAPDH檢測

總蛋白(bái)提取:4×106 K562細胞,400 g 離(lí)心收集,去(qù)上清,沉澱中加入200 μl RIPA(加2 μl 100 mM PMSF),冰上裂解5分(fēn)鍾,4℃ 16000 g 15 分(fēn)鍾,上清即爲總蛋白(bái)(TP)。

細胞漿蛋白(bái):4×106 K562細胞,400 g 離(lí)心收集,加入400 μl細胞裂解緩沖液A (加4 μl 100mM PMSF,加0.4 μl 1 M DTT),懸浮沉澱,冰浴5分(fēn)鍾;加入20 μl細胞裂解緩沖液B,混勻,冰上孵育5分(fēn)鍾,4℃ 16000g 5分(fēn)鍾,小心收集上清即爲細胞漿蛋白(bái)(CP),不要觸及沉澱。

細胞核蛋白(bái)提取:沉澱中計(jì)入100 μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性),1 μl Benzonase,37℃ 30 min,4 ℃ 16000 g 10分(fēn)鍾,上清即爲細胞核蛋白(bái)(NP)。

電泳:RTD6117-0420  200V 33-12 mA 55 min

轉膜:NC膜,1×RealBlot快(kuài)速轉膜液濕轉,穩流400 mA,電壓變化64-57 V,轉膜時間35 min

封閉:無蛋白(bái)快(kuài)速封閉液RT 10 min

一抗孵育;二抗孵育;檢測:ECL發光(guāng)檢測


 
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