動物核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(細胞樣品)
Animal Nuclear and
Cytoplasmic Protein Extraction Kit for Cells
産品貨号
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名稱
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規格
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RTD8301
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動物核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(細胞樣品)
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50 次
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● 産品簡介:
在研究細胞時經常要研究細胞的不同組份,而研究得(de)最多的兩個細胞組份就(jiù)是細胞核和細胞漿。分(fēn)離(lí)核蛋白(bái)和胞漿蛋白(bái),不僅可(kě)以用于研究蛋白(bái)在細胞内的定位,而且可(kě)以用于轉錄調控方面的研究,例如(rú)EMSA(也稱gel
shift),footprinting等。動物核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(Animal
Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit)提供了一種比較簡單方便地從(cóng)培養細胞中抽提細胞核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)的方法。約90分(fēn)鍾就(jiù)可(kě)以完成培養細胞的細胞核蛋白(bái)與細胞漿蛋白(bái)的分(fēn)離(lí)。抽提得(de)到的蛋白(bái)可(kě)以用于Western,EMSA,footprinting,報告基因檢測以及酶活力測定等實驗。
本試劑盒是通過細胞核提取緩沖液在低滲透壓條件(jiàn)下,使細胞充分(fēn)膨脹,破壞細胞膜,釋放(fàng)出細胞漿蛋白(bái),然後通過離(lí)心得(de)到完整的細胞核(細胞核可(kě)以重懸于細胞核貯存緩沖液中
-80℃貯存);細胞核用核蛋白(bái)提取試劑I裂解,配合核酸酶Benzonase消化掉核酸,離(lí)心得(de)到變性核蛋白(bái);或者使用核蛋白(bái)提取試劑II裂解,離(lí)心得(de)到非變性(活性)核蛋白(bái)。一般情況下,胞漿蛋白(bái)與核蛋白(bái)之間的交叉污染低于10%。
對于細胞樣品,如(rú)果每個樣品的數量5×106-1×107,本試劑盒可(kě)以抽提50個樣品。
● 産品組成:
産品編号
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名稱
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規格
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貯存
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RTD8301-01
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細胞裂解緩沖液A
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45 ml
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-20℃
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RTD8301-02
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細胞裂解緩沖液B
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1 ml
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4 ℃
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RTD8301-03
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細胞核貯存緩沖液
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0.5 ml
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-20℃
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RTD8301-04
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核蛋白(bái)提取試劑I(變性)
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5 ml
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-20℃
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RTD8301-05
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核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)
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5 ml
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-20℃
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RTD8301-06
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台盼藍染色液
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0.5 ml
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4℃
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PM1790S-01
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PMSF溶液(100 mM)
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1 ml
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-20℃
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RTT2106-01
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Benzonase(250 U/μl)
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50 μl
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-20℃
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DT0140P-01
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1 M DTT
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1 ml
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4℃(配制後-20℃)
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● 貯存條件(jiàn)和運輸:
根據标簽溫度貯存;有效期一年(nián);試劑盒濕冰運輸。
● 用前必讀(dú):
1. 離(lí)心機(jī)請(qǐng)調整成RCF/g模式,按照(zhào)離(lí)心力設置離(lí)心機(jī)(不要根據轉速rpm模式設置),所有離(lí)心步驟都(dōu)需要在4℃低溫離(lí)心機(jī)中進行。
2. 蛋白(bái)提取推薦添加蛋白(bái)酶抑制劑,根據蛋白(bái)酶抑制劑母液濃度提前添加在蛋白(bái)提取溶液中(如(rú)抑制劑母液是 100×,添加時按照(zhào)1:100添加)。研究蛋白(bái)磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)。
3. 蛋白(bái)定量推薦使用BCA方法,可(kě)以選擇BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)。
● 使用方法:
一 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)的提取:
1.
1準備溶液:常溫溶解試劑盒中的試劑,溶解後立即放(fàng)置在冰上,混勻。取适當量的細胞裂解緩沖液A,在使用前加入PMSF溶液和/或磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)和1/1000體(tǐ)積的1
M DTT,随後立即放(fàng)于冰上待用。
組份
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一次提取需要體(tǐ)積
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PMSF溶液
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1
M DTT
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Benzonase
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細胞裂解緩沖液A
(步驟1.4.1和1.5.1)
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800 μl
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8 μl
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0.8 μl
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-
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核蛋白(bái)提取試劑I(變性)
(步驟1.6.1.2)
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100 μl
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1 μl
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0.1 μl
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1 μl
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核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(步驟1.6.2.2)
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50 μl
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0.5 μl
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-
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-
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1.2
準備細胞:
1.2.1
對于貼壁細胞:用PBS漂洗一遍,棄PBS;再加入适量PBS,用細胞刮刀刮下細胞,或用0.02%
EDTA(0.5
mM)溶液處理(lǐ)細胞使細胞不再貼壁很緊,并用移液器吹打下細胞。450
g 4℃離(lí)心5
min收集細胞,盡最大(dà)努力吸盡上清,留下細胞沉澱備用。盡量避免用胰酶消化細胞,以免胰酶降解需抽提的目的蛋白(bái)。
1.2.2
對于懸浮細胞:450
g 4℃離(lí)心5
min收集細胞,用PBS洗一遍,離(lí)心收集細胞,盡最大(dà)努力吸盡上清,留下細胞沉澱備用。
1.3 按照(zhào)下表大(dà)體(tǐ)估算提取溶液使用體(tǐ)積:
細胞類型
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培養器皿
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細胞數量
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細胞沉澱體(tǐ)積(PCV)(μl)
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細胞裂解緩沖液A(μl)
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懸浮細胞
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5-10×106
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>50
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400
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貼壁細胞
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96孔闆
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~1×105
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調整細胞數目到5-10×106
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24孔闆
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~5×105
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調整細胞數目到5-10×106
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6孔闆
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~2.5×106
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調整細胞數目到5-10×106
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25cm2培養瓶
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~2×106
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調整細胞數目到5-10×106
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75cm2培養瓶
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~8×106
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~80
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35
mm培養皿
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~2×106
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調整細胞數目到5-10×106
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60
mm培養皿
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~5×106
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~50
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100
mm培養皿
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~1.5×107
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調整細胞數目到5-10×106
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注:(二百萬,2×106)HeLa細胞,其細胞沉澱體(tǐ)積(PCV,Packed Cell Volume)大(dà)約爲20 μl。
1.4
胞漿蛋白(bái)提取:
1.4.1細胞沉澱中加入準備好的400
μl細胞裂解緩沖液A(含抑制劑和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸細胞沉澱5-10次,把細胞沉澱完全懸浮并分(fēn)散開,冰浴5分(fēn)鍾。
1.4.2
加入20
μl 細胞裂解緩沖液B(按照(zhào)細胞裂解緩沖液A體(tǐ)積的1/20加入),混勻,冰浴5-10分(fēn)鍾。
注1:此步驟盡量不要漩渦震蕩沉澱,否則得(de)到的細胞漿蛋白(bái)可(kě)能會污染核蛋白(bái)。
注2:裂解緩沖液對不同細胞的裂解能力有不同,敏感細胞裂解5分(fēn)鍾足夠,其他(tā)細胞冰浴時間不要超過10分(fēn)鍾。
1.4.3
4℃ 16000g 離(lí)心5分(fēn)鍾,取80%上清即爲胞漿蛋白(bái),保存備用。
注:吸取上清時千萬不要觸及沉澱,可(kě)以隻取80%體(tǐ)積上清,以免胞漿蛋白(bái)中污染細胞核。每5-10×106細胞用400
μl細胞裂解緩沖液A裂解後獲得(de)的上清,其細胞漿蛋白(bái)濃度約爲1-2 μg/μl,不同細胞略有不同。
1.5
收集細胞核:
1.5.1
徹底去(qù)除步驟1.4.3離(lí)心管内上清,沉澱中再次加入400
μl細胞裂解緩沖液A(含PMSF和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸沉澱至沉澱完全散開(注:渦旋震蕩不易懸浮沉澱),冰浴5分(fēn)鍾。
注:此步驟目的是徹底漂洗沉澱中殘餘的未裂解細胞,可(kě)以大(dà)大(dà)提高細胞核的純度
1.5.2
4℃ 16000g 離(lí)心5-10分(fēn)鍾,徹底去(qù)除上清,沉澱即爲完整的細胞核。
注:盡量完全把上清去(qù)除幹淨,否則細胞核中會污染胞漿蛋白(bái)。
1.5.3
細胞核沉澱中加入50
μl細胞核貯存緩沖液,用吸頭完全重懸沉澱,得(de)到細胞核溶液。該溶液可(kě)以-80℃貯存。
1.5.4 可(kě)選步驟:取10 μl細胞核溶液,加入10 μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分(fēn)鍾,顯微鏡下觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核爲均一藍色,沒有粘連(如(rú)圖)。
pt;mso-ansi-language:EN-US;
mso-fareast-language:ZH-CN;mso-bidi-language:AR-SA'>可(kě)選步驟:取10 μl細胞核溶液,加入10 μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分(fēn)鍾,顯微鏡下觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核爲均一藍色,沒有粘連(如(rú)圖)。
1.6 細胞核蛋白(bái)提取:
1.6.1 變性核蛋白(bái)提取:
注:此步驟使用含有SDS的提取試劑B,完全裂解核膜,釋放(fàng)出細胞核内容物,提取的是完全變性的核蛋白(bái),适用于SDS-PAGE電泳Western
Blot檢測。
1.6.1.1
取一管50
μl細胞核溶液,4℃
16000g 離(lí)心2分(fēn)鍾,去(qù)除上清,保留沉澱。
1.6.1.2
沉澱中加入100
μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性)(含PMSF和DTT)和1
μl Benzonase,吸頭重懸沉澱,37℃處理(lǐ)30分(fēn)鍾至幾乎無可(kě)見(jiàn)不溶物。
注:加入核蛋白(bái)提取試劑I(變性)後,細胞核裂解釋放(fàng)出大(dà)量核酸,溶液非常粘稠,核酸酶Benzonase可(kě)以消化掉核酸,降低粘度。
1.6.1.3
4℃16,000g離(lí)心10分(fēn)鍾,立即吸取上清至一預冷(lěng)的離(lí)心管中,即爲抽提得(de)到的變性核蛋白(bái)。可(kě)以立即使用,也可(kě)以-80℃凍存。每5-10×106細胞用100微升提取試劑B裂解後獲得(de)的上清,可(kě)以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其核蛋白(bái)濃度約爲1-3
μg/μl,不同細胞略有不同。
1.6.2 非變性核蛋白(bái)提取:
注:此步驟使用高鹽緩沖液使得(de)細胞核收縮,核酸結合蛋白(bái)(如(rú)轉錄因子)與核酸分(fēn)離(lí),擴散到細胞核外部,離(lí)心後上清中爲非變性(活性)核蛋白(bái),适用EMSA,轉錄因子活性分(fēn)析等實驗。
1.6.2.1
取一管50
μl細胞核溶液,4℃
16000g 離(lí)心2分(fēn)鍾,去(qù)除上清,保留沉澱。
1.6.2.2
沉澱中加入50
μl核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(含PMSF,不要添加DTT),吸頭重懸沉澱,4℃旋轉混勻30
min,至最後得(de)到的溶液無可(kě)見(jiàn)懸浮物。
注:如(rú)不能旋轉混勻,可(kě)以冰浴30 min,每隔5分(fēn)鍾混勻一次。
1.6.2.3
4℃16,000g離(lí)心10分(fēn)鍾,立即吸取上清至一預冷(lěng)的離(lí)心管中,即爲抽提得(de)到的活性核蛋白(bái)。可(kě)以立即使用,也可(kě)以-80℃凍存。每5-10×106細胞用50微升核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)裂解後獲得(de)的上清,可(kě)以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其細胞核蛋白(bái)濃度約爲1-3
μg/μl,不同細胞略有不同。
二 關于胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)産量和質量的評價:
2.1蛋白(bái)産量:
細胞系
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細胞數量
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胞漿蛋白(bái)
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核蛋白(bái)
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K562
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1×107
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~0.8 mg
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~0.2 mg
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HEK293
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4×107
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~9.4 mg
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~0.55 mg
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Jurkat
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1.5×107
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~2.6 mg
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~0.23 mg
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Hela
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5.4×106
|
~1.9 mg
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~0.34 mg
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NIH-3T3
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7.9×106
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~1.9 mg
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~0.28 mg
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2.2 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)質量評價:
蛋白(bái)分(fēn)區提取的質量評價首先看(kàn)提取的蛋白(bái)是否是分(fēn)區蛋白(bái),其次要看(kàn)分(fēn)區蛋白(bái)是否有明顯的富集,其三要看(kàn)提出的分(fēn)區蛋白(bái)是否有其他(tā)組分(fēn)交叉污染,最後看(kàn)提取的分(fēn)區蛋白(bái)中是否可(kě)以檢測出目的蛋白(bái)。使用專門(mén)的胞漿内參和細胞核檢測(下表),可(kě)以初步确認提出的是胞漿蛋白(bái)還(hái)是核蛋白(bái)。蛋白(bái)是否有效富集需要用總蛋白(bái)作(zuò)爲對照(zhào),與總蛋白(bái)相(xiàng)比,胞漿蛋白(bái)内參或核内參是否有明顯富集。交叉污染可(kě)以用其他(tā)組分(fēn)内參檢測蛋白(bái)樣品,如(rú)關注胞漿蛋白(bái)中是否有細胞核蛋白(bái)污染,可(kě)以使用核蛋白(bái)内參如(rú)Lamin
B1檢測胞漿蛋白(bái),檢測無條帶即說(shuō)明胞漿蛋白(bái)與細胞核組分(fēn)無交叉污染。用目标蛋白(bái)抗體(tǐ)檢測分(fēn)區蛋白(bái),驗證是否可(kě)以檢測到目的蛋白(bái),蛋白(bái)大(dà)小是否符合預期。
位置
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内參名稱
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大(dà)小 kD
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胞漿蛋白(bái)内參
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GAPDH
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37
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β-Actin
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45
|
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β-Tubulin
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55
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推薦
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核内參
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Histone H3
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17
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存在于線粒體(tǐ)中,胞漿中可(kě)以檢測到
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PCNA
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36
|
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Lamin B1
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68
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推薦
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三 實驗示例:
Jurkat總蛋白(bái),細胞漿蛋白(bái),細胞核蛋白(bái)GAPDH檢測
總蛋白(bái)提取:4×106 K562細胞,400 g 離(lí)心收集,去(qù)上清,沉澱中加入200
μl RIPA(加2 μl 100 mM PMSF),冰上裂解5分(fēn)鍾,4℃
16000 g 15 分(fēn)鍾,上清即爲總蛋白(bái)(TP)。
細胞漿蛋白(bái):4×106 K562細胞,400 g 離(lí)心收集,加入400
μl細胞裂解緩沖液A (加4
μl 100mM PMSF,加0.4 μl 1 M DTT),懸浮沉澱,冰浴5分(fēn)鍾;加入20
μl細胞裂解緩沖液B,混勻,冰上孵育5分(fēn)鍾,4℃
16000g 5分(fēn)鍾,小心收集上清即爲細胞漿蛋白(bái)(CP),不要觸及沉澱。
細胞核蛋白(bái)提取:沉澱中計(jì)入100
μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性),1
μl Benzonase,37℃ 30 min,4
℃ 16000 g 10分(fēn)鍾,上清即爲細胞核蛋白(bái)(NP)。
電泳:RTD6117-0420 200V 33-12 mA 55 min
轉膜:NC膜,1×RealBlot快(kuài)速轉膜液濕轉,穩流400
mA,電壓變化64-57 V,轉膜時間35
min
封閉:無蛋白(bái)快(kuài)速封閉液RT 10 min
一抗孵育;二抗孵育;檢測:ECL發光(guāng)檢測