2×CTAB提取緩沖液
● 産品編号及規格:
貨号
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名稱
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規格
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貯存
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RTG2405-200ml
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2×CTAB提取緩沖液
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200 ml
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RT
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還(hái)原劑
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1 ml
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RT
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RTG2405-500ml
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2×CTAB提取緩沖液
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500 ml
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RT
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還(hái)原劑
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1 ml
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RT
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● 産品介紹:
CTAB (hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一種陽離(lí)子去(qù)污劑,具有從(cóng)低離(lí)子強度溶液中沉澱核酸與酸性多聚糖的特性。在高離(lí)子強度的溶液中(>0.7 M NaCl) CTAB與蛋白(bái)質和多聚糖形成複合物而不沉澱核酸。通過有機(jī)溶劑抽提,去(qù)除蛋白(bái)、多糖、酚類等雜質後加入醇(乙醇或異丙醇)沉澱即可(kě)使核酸分(fēn)離(lí)出來(lái)。
2×CTAB提取緩沖液成分(fēn):2%(w/v,55
mM)CTAB,100 mM Tris (pH 8.0),20
mM EDTA,1.4 MNaCl,,還(hái)原劑(随用随加) 。
● 儲存及運輸:
常溫貯存一年(nián);常溫運輸。
● 實驗操作(zuò)步驟:
一 DNA提取:
1. 2×即用型CTAB提取液配制:
按照(zhào)終濃度0.2% (v/v)加入還(hái)原劑,如(rú)1 ml 2×CTAB提取緩沖液中加入2 μl還(hái)原劑。2×即用型CTAB提取液建議(yì)現用現配。
2. 材料研磨:
取0.2-0.5克新鮮植物材料,于液氮中研磨成粉末。
3. 樣品裂解:
按照(zhào)每100 mg研磨粉末使用0.5 ml提取緩沖液的比例将粉末轉入1.5
ml離(lí)心管中,立即加入65℃預熱(rè)的2×即用型CTAB提取緩沖液,65℃水浴30分(fēn)鍾,間歇混勻。
注:提取緩沖液使用量不要超過0.7 ml,否則後續純化不能在一個離(lí)心管内完成;CTAB溶液在低于15℃時會形成沉澱析出,因此,在将其加入冰冷(lěng)的植物材料之前必須預熱(rè),且離(lí)心時溫度不要低于15℃。
4. 離(lí)心去(qù)雜質:
14000 g 常溫離(lí)心5分(fēn)鍾,轉移上清至新的1.5 ml離(lí)心管中。
5. 去(qù)除RNA:
上清中加入1/100上清體(tǐ)積的RNaseA溶液(10
mg/ml)(貨号:RN001),如(rú)500
μl上清中加如(rú)5 μl RNaseA溶液,37℃處理(lǐ)20分(fēn)鍾。
6. 第一次抽提純化:
6.1 步驟5溶液中加入等體(tǐ)積的Tris酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),輕緩颠倒離(lí)心管混勻8-10次,常溫14000 g 離(lí)心10分(fēn)鍾,保留上清。
6.2. 重複抽提一次。
7. 第二次純化:
上清中加入等體(tǐ)積氯仿:異戊醇(24:1),颠倒離(lí)心管混勻8-10次,常溫14000 g離(lí)心10分(fēn)鍾,保留上層水相(xiàng)。
8. 沉澱DNA:
8.1 将上層水相(xiàng)轉入新的1.5 ml離(lí)心管中,加入0.6倍體(tǐ)積的冰冷(lěng)異丙醇,輕柔混勻,-20℃靜(jìng)
置30分(fēn)鍾;
8.2 14000
g4℃離(lí)心10分(fēn)鍾。
9. 漂洗DNA:
9.1
去(qù)上清液, 加入1ml
70%乙醇漂洗沉澱,4℃14000 g 3分(fēn)鍾,吸棄乙醇。
9.2 4℃ 14000 g 1分(fēn)鍾,用移液器吸盡殘餘乙醇,超淨台吹幹沉澱。
注:沉澱不能徹底幹燥,否則不好溶解。
10. 貯存DNA:
加入50-100
μl的超純水或TE緩沖液溶解DNA,-20℃保存備用。
二 RNA提取:
注:以下程序請(qǐng)注意所有試劑都(dōu)要保證RNase-free。
1. 2×即用型CTAB提取液(RNase-free,現用現配)配制:
2×CTAB提取緩沖液中按照(zhào)1/1000體(tǐ)積加入DEPC,如(rú)100
ml中加入100 μl DEPC,混勻後過夜處理(lǐ),高溫高壓,即爲2×即用型CTAB提取緩沖液(RNase-free)。按照(zhào)終濃度1 % (v/v)加入還(hái)原劑,如(rú)1 ml 2×CTAB提取緩沖液(RNase-free)中加入10 μl還(hái)原劑。2×即用型CTAB提取液建議(yì)現用現配。
2. 材料研磨:
取0.2-0.5克新鮮植物材料,于液氮中研磨成粉末。
3. 樣品裂解:
按照(zhào)每100 mg研磨粉末使用0.5 ml提取緩沖液的比例将粉末轉入1.5
ml離(lí)心管中,立即加入65℃預熱(rè)的2×即用型CTAB提取緩沖液,65℃水浴30分(fēn)鍾,間歇混勻。
注:提取緩沖液使用量不要超過0.7 ml,否則後續純化不能在一個離(lí)心管内完成;CTAB溶液在低于15℃時會形成沉澱析出,因此,在将其加入冰冷(lěng)的植物材料之前必須預熱(rè),且離(lí)心時溫度不要低于15℃。
4. 離(lí)心去(qù)雜質:
14000 g 常溫離(lí)心5分(fēn)鍾,轉移上清至新的1.5 ml離(lí)心管中。
5. 第一次純化:
上清中加入等體(tǐ)積的水酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),輕緩颠倒離(lí)心管混勻8-10次,常溫14000 g 離(lí)心10分(fēn)鍾。
6. 第二次純化:
将上清液轉入另一1.5 ml離(lí)心管中,加入等體(tǐ)積氯仿:異戊醇(24:1),颠倒離(lí)心管混勻8-10次,常溫14000 g離(lí)心10分(fēn)鍾。
7. 沉澱RNA:
将上層水相(xiàng)轉入新的1.5 ml離(lí)心管中,加入1/2體(tǐ)積7.5 M LiCl(RNase-free)(貨号:LC1030),輕柔混勻,-20℃ 靜(jìng)置30分(fēn)鍾;14000
g4℃離(lí)心10分(fēn)鍾。
9. 漂洗RNA:
9.1 去(qù)上清液, 沉澱中加入1ml
70%乙醇(RNase-free),吹打漂洗沉澱,14000 g4℃3分(fēn)鍾,吸棄乙醇。
9.2 14000 g4℃1分(fēn)鍾,用移液器吸盡殘餘乙醇,超淨台吹幹沉澱。
注:RNA沉澱不能過分(fēn)幹燥,否則不好溶解。
10. 貯存RNA:
加入50-100
μl的RNase-free水溶解RNA,-80℃保存備用。
使用該産品發表部分(fēn)文章(zhāng)列表:
1. [IF=4.35] Combined Effect of High-Pressure Processing with Spice Extracts on Quality of Low-Salt Sausage during Refrigerated Storage.
Author:Qing Xiao, Mei Xu, Baocai Xu, Conggui Chen, Jieying Deng and Peijun Li
Journal: Foods. 2021, 10, 2610.
Institution:Hefei University of Technology
Paper link:https://www.mdpi.com/2304-8158/10/11/2610
2. [IF=3.579] Effect of Lactobacillus plantarum andStaphylococcus xylosus on flavour development and bacterial communities in Chinese dry fermented sausages.
Author: YaqingXiao,PeijunLi
Journal: Food Research International. 2020.
Institution:Hefei University of Technology
Paper link:https://doi.org/10.1016/j.foodres.2020.109247