Tricine多肽電泳參考文獻
何時使用Tricine-SDS-PAGE檢測小分(fēn)子肽?
如(rú)果你(nǐ)感興趣的蛋白(bái)小于20KD,你(nǐ)就(jiù)要使用Tricine-SDS-PAG系統來(lái)分(fēn)離(lí)小肽了。Tricine-SDS-PAGE系統是可(kě)以分(fēn)離(lí)1-100KD的蛋白(bái)質。此系統最适合分(fēn)離(lí)低于30KD的蛋白(bái)質。
相(xiàng)關産品:超低分(fēn)子量蛋白(bái)電泳試劑盒(貨号:RTD6120)
Tricine-SDS-PAGE與傳統SDS-PAGE的區别:
1 分(fēn)離(lí)膠中更高的Tris濃度:終濃度爲0.75M;普通SDS-PAGE爲0.375M
2 分(fēn)離(lí)膠和濃縮膠中的pH都(dōu)是8.45
3 分(fēn)離(lí)膠中更高的交聯度(C)-5%,普通的SDS-PAGE爲C一般爲3.3%。
小肽的電泳:
1 關于陰極緩沖液和陽極緩沖液:
Tricine-SDS-PAGE系統不同于常規的SDS-PAGE,使用兩種緩沖液電泳。電泳槽内槽是1×陰極緩沖液,含有Tricine和SDS。外槽是1×陽極緩沖液,是0.2M Tris。由于電泳槽内外槽緩沖液不一樣,電泳前要檢測電泳槽是否漏液,如(rú)果漏液的話(huà)将導緻内外槽緩沖液混合,導緻電泳結果不好。如(rú)果發現内槽緩沖液漏液,可(kě)以将外槽緩沖液加滿到和内槽緩沖液齊平。
2 關于電泳時的電壓:
濃縮膠一般用穩壓80-100V,如(rú)果使用新鮮的緩沖液,這時的電流應該在20mA左右,如(rú)果電流太小,請(qǐng)檢查緩沖液以及電泳設備是否有問(wèn)題。當指示前沿至濃縮膠和分(fēn)離(lí)膠交界時,電壓可(kě)以調高到120-150V。整個電泳時間約需2-3小時。
3 關于電泳的指示前沿:
由于溴酚藍在Tricine-SDS-PAGE系統中泳動很快(kuài),很快(kuài)就(jiù)跑到緩沖液中去(qù)了。超低分(fēn)子量蛋白(bái)Marker和2×Tricine 上樣緩沖液中的指示前沿是考馬斯亮藍G-250。電泳中隻要指示前沿跑不丢,小肽就(jiù)不會跑丢。然而,考馬斯亮藍G-250作(zuò)爲指示前沿的缺點是在分(fēn)離(lí)膠中比較彌散。如(rú)果電泳時間較短(duǎn),染色時會遮擋3KD左右的小肽。
4 小肽的染色:
由于小肽還(hái)有較少的氨基酸,染色時結合的染料就(jiù)少,導緻染色靈敏度比較低。上樣時要加大(dà)上樣量。另外,低于5KD的小提容易從(cóng)PAGE膠上脫離(lí),染色前最好有個固定步驟(0.5%戊二醛,30%乙醇)。爲了更好的染色小肽,可(kě)以選擇FastBlue蛋白(bái)染色液(Cat No:RTD6202),該産品除具有染色快(kuài),無毒,靈敏性高等特點外,還(hái)能對小肽在染色中起到固定作(zuò)用,不至于小肽在染色和脫色中從(cóng)凝膠中脫離(lí),是常規染色液的理(lǐ)想替代品。
小肽的轉膜/Western Blot實驗
由于小肽比較小,轉膜時要注意小肽非常容易透過PVDF膜。兩種方法可(kě)以解決這一問(wèn)題:兩張PVDF膜重疊在一起;縮短(duǎn)轉膜時間(半幹法轉移,200mA 15-20分(fēn)鍾就(jiù)可(kě)以了)。轉膜使用0.22 μm的PVDF膜。濕轉(轉膜緩沖液加20%甲醇,不加或少加SDS,200mA 30-35分(fēn)鍾)。
小肽電泳文獻:
1 Schagger, H. & von Jagow, G. Tricine–sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis for the separation of proteins in the range from 1–100 kDalton. Anal. Biochem. 166, 368–379 (1987). PDF下載
最原始小肽電泳的文獻。
2 Schagger, H. Tricine–SDS-PAGE. Nature Protocols. 1,16-23,2006 PDF下載
87年(nián)的作(zuò)者Schagger在Nature Protocols 開刊文章(zhāng),寫的精細,值得(de)推薦。
3 兩篇國(guó)内文獻,主要討(tǎo)論尿素的作(zuò)用。
多肽的電泳分(fēn)離(lí) 2004
有效分(fēn)離(lí)1kDa小肽的Tricine-SDS-PAGE方法 2004