高分(fēn)子量蛋白(bái)(大(dà)于150 kD)Western Blot攻略
高分(fēn)子量蛋白(bái)(大(dà)于150
kD)Western Blot攻略
注:該文引自(zì)基因幫公衆号天才試劑君文章(zhāng),略有修改。 Ver.730875
● 一 選對凝膠很重要
三種最常見(jiàn)的凝膠系統包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate系統。
Tris-Glycine凝膠的pH爲8.6,且保質期很短(duǎn),一般4-8℃保存有效期一個月。在跑膠的過程中,凝膠系統的pH還(hái)有上升的趨勢,可(kě)達到9.5,這會導緻蛋白(bái)降解和低分(fēn)辨率。
Bis-Tris凝膠的pH爲~6.5,相(xiàng)對Tris-Glycine凝膠,穩定性和保質期都(dōu)有所增加,4-8℃貯存可(kě)以保存一年(nián)。但(dàn)這種凝膠更适合于低分(fēn)子量電泳分(fēn)離(lí)(低于200 kD),不适合高分(fēn)子量蛋白(bái)電泳。
Tris-Acetate 凝膠的pH爲~7,跑大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)會呈現很高的分(fēn)辨率,同時4-8℃貯存可(kě)以保存一年(nián)。
所以跑大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)時,我們推薦使用Tris-Acetate 凝膠(貨号:RTD6162;RTD6155)。
● 二 凝膠濃度很重要
既然選擇了Tris-Acetate 凝膠,要考慮凝膠濃度的問(wèn)題。凝膠濃度與孔徑成反比:濃度越小,孔越大(dà),較大(dà)的蛋白(bái)質更容易通過較大(dà)的孔,所以建議(yì)使用低百分(fēn)比的Tris醋酸凝膠(貨号:RTD6162),如(rú)6%等度膠。也可(kě)以使用梯度凝膠,但(dàn)是制作(zuò)梯度凝膠會恨棘手,需要一個梯度凝膠生(shēng)成系統(貨号:RT-GZY02),不過現在很多公司都(dōu)會出售具有不同範圍的梯度預制膠(貨号:RTD6155),節省時間。
● 三 電泳内槽緩沖液需要添加抗氧化劑
Tris-醋酸電泳使用10×Tris-醋酸-SDS電泳緩沖液(貨号:TA050),經典的Tris-甘氨酸-SDS電泳緩沖液無法兼容使用。由于DTT在pH中性時,基本不随着樣品泳動,爲保證蛋白(bái)樣品在電泳中維持還(hái)原力,Tris-Acetate 凝膠電泳時,電泳槽内槽緩沖液需要添加抗氧化劑(貨号:TA1510),這樣可(kě)以保證整個電泳過程中蛋白(bái)的變性還(hái)原狀态,提高樣品的分(fēn)辨率。
● 四 提高轉膜緩沖液中的SDS,減少甲醇
高分(fēn)子量蛋白(bái)轉膜緩沖液中的組成至關重要。如(rú)果有甲醇存在,大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)很容易沉澱,可(kě)以通過減少轉膜緩沖液中的甲醇百分(fēn)比(10%或更低)來(lái)避免這種情況發生(shēng)。爲了進一步确保蛋白(bái)質不會沉澱,考慮在轉膜緩沖液中添加SDS至終濃度爲0.05%-0.1%。SDS向蛋白(bái)添加均勻的負電荷,使得(de)它們更容易從(cóng)凝膠轉移到膜上。高分(fēn)子量蛋白(bái)的轉膜緩沖液可(kě)以選擇10×Tris-醋酸轉膜緩沖液(濕轉,粉末型)(貨号:TA5030P)
● 五 選擇合适的轉印膜
轉印膜一般有PVDF膜或NC膜,跑大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)建議(yì)選擇PVDF膜。如(rú)前面所說(shuō),如(rú)果有甲醇存在,大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)很容易沉澱。而PVDF膜可(kě)以不需要在轉膜緩沖液中添加甲醇,目的蛋白(bái)轉印的機(jī)會更高。PVDF膜有各種孔徑尺寸,最常見(jiàn)的是0.22 μm和0.45
μm。與凝膠一樣,較大(dà)的蛋白(bái)比較小的蛋白(bái)更容易穿過大(dà)孔隙。高分(fēn)子量蛋白(bái)質可(kě)以用0.45μm膜(貨号:ML-PV-131545-5)轉移,避免使用0.22 μm孔徑。
● 六 增加轉印時間
在正确的選擇完凝膠、轉印膜及轉移緩沖液後,轉印正式開始。半幹轉快(kuài)且方便,但(dàn)不适用于大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)。大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)建議(yì)濕轉,因爲大(dà)分(fēn)子蛋白(bái)轉移時間很慢(màn),推薦350-400 mA轉移90 min或 4℃,40 mA,轉印過夜。
● 七 關于轉印膜封閉
沒有任何一種封閉試劑能通用于蛋白(bái)封閉。BSA通常作(zuò)爲NC膜的封閉液,但(dàn)是對于PVDF膜,它的封閉效果并不是最好。大(dà)蛋白(bái)轉膜後的封閉可(kě)以選擇5%脫脂奶粉(貨号:WN1070)。
另外,不要讓PVDF膜在檢測過程中的任何時間點幹透,如(rú)果膜部分(fēn)變幹,可(kě)以讓膜完全幹掉,然後用甲醇重新潤濕,之後用緩沖液浸泡,繼續操作(zuò)。